Trung tâm Ung Bướu Bệnh viện Trung ương Huế (tiền thân là Khoa Ung Bướu- thành lập năm 1994) chính thức đi vào hoạt động từ năm 2015, đúng vào dịp khai trương máy xạ trị gia tốc thế hệ mới Elekta Axesse. Trung tâm hiện tại có quy mô 640 giường bệnh đạt chuẩn. Với đội ngũ y bác sĩ và chuyên gia có trình độ chuyên môn cao với nhiều năm kinh nghiệm, cùng với cơ sở vật chất hiện đại và công nghệ cao, máy móc tiên tiến, Trung tâm Ung Bướu là cơ sở điều trị ung thư hàng đầu tại Việt Nam, đảm bảo đáp ứng tốt nhu cầu khám chữa bệnh ung thư cho người dân khu vực miền Trung và cả nước, và cả bệnh nhân nước ngoài. Ngoài hai phòng chức năng (Phòng Hành chính- Tổng hợp và Phòng Nghiên cứu khoa học- Đào tạo- Hợp tác Quốc tế), Trung tâm có 8 khoa, phòng lâm sàng (Khoa Khám bệnh, Khoa Phẫu thuật, Khoa Xạ 1, Khoa Xạ 2, Phòng Máy xạ trị, Khoa Nội Ung Bướu 1, Khoa Nội Ung Bướu 2 và Khoa Chăm sóc giảm nhẹ), cùng với hệ thống các phòng xét nghiệm cận lâm sàng phục vụ cho việc chẩn đoán bệnh ung thư (Giải phẫu bệnh, Siêu âm, Nội soi, Sinh hóa- Huyết học, X-quang vú,…) Bên cạnh đó, trung tâm còn có các khu vực Y học cổ truyền (ngâm chân, châm cứu, xoa bóp,…) và phòng tập Yoga dành cho bệnh nhân.